阜宁县卫生进修学校是高水平专业群建设单位，临床医学、护理专业是教育部高等职业院校创新发展行动计划骨干专业；药学专业为教育部首批现代学徒制试点专业；护理、临床医学、医学检验技术专业为国家级重点建设专业；临床医学、护理、口腔医学、医学检验技术、医学影像技术、助产等专业为省级特色专业；医学检验技术、口腔医学、临床医学、护理等专业为省级综合改革试点专业；康复治疗技术、助产、药学为江苏省创新发展行动计划骨干专业，第一附属医院、第二附属医院为省级高等职业教育示范性综合实训基地。